منصة الرسائل والاطاريح: Detection of SARS-COV-2 and bacterial co-infections in patients with respiratory diseases in Babylon province

الخلاصة

المتلازمة التنفسية الحادة الشديدة - فيروس كورونا -2 المسؤول عن الجائحة المستمرة في جميع أنحاء العالم ولا يزال يُسجل عدد كبير جدًا من الإمراضية والوفيات. يسبب فايروس كورونا SARS- COV-2 مرضًا تنفسيًا يهدد الحياة . تهدف الدراسة الحالية إلى تحديد معدل وتسلسل عدوى فايروس كورونا - SARS-COV-2 بين المرضى الذين يعانون من أعراض تنفسية في محافظة بابل ، بينت الدراسة الإصابة بفايروس كورونا والعدوى البكتيرية المصاحبة للإصابة . تضمنت الدراسة 50 مريضاً مصاباً بـ COVID-19 الذين تم ادخالهم الى وحدة العناية المركزة الوبائية في قسم الطوارئ في مستشفى الإمام الصادق التعليمي ومدينة المرجان الطبية في محافظة بابل ، 28 منهم من الذكور و 22 من الإناث ، وتتراوح أعمارهم بين 20-80 . عامًا ومقارنتها بـ 50 فردًا يتمتعون بصحة جيدة خلال الفترة من سبتمبر إلى نوفمبر 2021 ، وتم تأكيد ذلك من خلال تفاعل البوليمير المتسلسل للنسخ العكسي . تم جمع مسحات البلعوم الأنفي من هذه الدراسة التي شملت جميع المرضى وأجريت عليهم مباشرة. يوضع في أنبوب يحتوي على 2 مل من وسط النقل الفيروسي (VTM) ثم يخزن في درجة حرارة - 20درجة مئوية حتى وقت استخراج الحمض النووي الراي بوسي ومعالجة تفاعل البوليمير المتسلسل للنسخة العكسية. مسحات البلعوم الأنفي والبلعوم الفموي للعدوى البكتيرية للبكتيريا التشخيصية عن طريق جهاز vitik2 إلى موجبة لصبغة غرام وسالبة لصبغة غرام هذه البكتيريا مصاحبة مع COVID-19. يحتاج جائحة COVID-19 ، الذي يحدث في جميع أنحاء العالم ، إلى اهتمام جاد. يمكن أن يتسبب COVID-19 الذي بدأه فيروس من نوع RNA في حدوث مشاكل أكثر خطورة لاحقًا بسبب قدرته على التحور. كود المادة الوراثية لفايروس SARS-COV-2 لبروتينات ORF1a / ORF1ab وأربعة بروتينات هيكلية تمت دراستها على نطاق واسع كأهداف دوائية رئيسية. تحتوي المادة الوراثية أيضًا على عدد متغير من إطارات القراءة المفتوحة (ORFs) لترميز البروتينات الإضافية التي ليست ضرورية لتكرار الفيروس ، ولكن يبدو أن لها دورًا في التسبب في المرض. أجريت هذه الدراسة على 50 مسحة من البلعوم الأنفي باستخدام RT-PCR و PCR لتضخيم الجين ORF1ab بعد ذلك ، خضعت خمس عينات لتحليل النشوء والتطور. تم تأكيد نتائج الدراسة الحالية من خلال تحليل ORF1ab الذي يُظهر أن ORF1ab يختلف ويتحور ولديه عدد من الطفرات التي يمكن أن تؤثر عليه في التشابه بين البلدان بهدف الكشف عن عزلنا المحلي كان له 100 هوية مع الولايات المتحدة استنتجت أن التأثير المتطرف لانتقال الفيروس وهو حيازة وراثية متحركة. من خمسين بمتوسط عمر (20-80) سنة ، تم تقسيم مرضى COVID-19 إلى مجموعتين : 28 (56%) من الذكور و 22 (44%) من الإناث. جميع الأفراد ثبتت إصابتهم بالعدوى البكتيرية بشكل إجمالي ، بما في ذلك ، Klebsiella pneumonia (7) عينات ، Streptococcus pneumonia (5) ، (Acinetobacter baumannii (5 ،مع وجود البكتيريا الأخرى انتهازية والبعض الآخر نبات طبيعي. أظهر توزيع مجتمع الدراسة حسب الجنس عدم وجود فرق معنوي عند القيمة p (0.54) ، وبحسب العمر كشفت الدراسة الحالية عن وجود فرق معنوي عند قيمة p( 0.080) ، تظهر نسبة الإصابة بفيروس SARS-COV-2 فرقًا معنويًا عند القيمة( p (0.000 ، يظهر المرض المزمن فرقاً معنوياً عند قيمة (p (0.001 ، النسبة الفردية للأمراض المزمنة (24.438). يظهر الارتباط بين الفئة العمرية ونوع العدوى المشتركة للبكتيريا بلمريض المصاب بفايروس كورونا- COV-2 SARS-فرقًا معنويًا عند قيمة( p (0.016 ، تظهر نسبة الإصابة ونوع البكتيريا فرقًا معنويًا عند قيمة( p (0.002 ، الارتباط بين المرض المزمن ونوع البكتيريا يظهران فرقاً معنوياً عالياً عند قيمة (p (0.0001. يظهر الارتباط بين الملقح ونوع البكتيريا فرق معنوي عند قيمة( p (0.0001 *. يظهر الارتباط بين نوع البكتيريا والمهنة فرقاً معنوياً عند قيمة p (0.001). نسبة الإصابة بالارتباط وعدوى فايروس كورنا COV-2 SARS- المسحة الأنفية البلعومية ، تظهر فرق معنوي عند قيمة p (0.000). المعاملة النوعية للارتباط مع المضاد الحيوي ونوع البكتيريا ، تظهر معنوية عند القيمة p (0.000)