منصة الرسائل والاطاريح: تحديد ثنائي النوكليوتيد لجين fimH ، وتوقع العامل المثبط له في الإشريشية القولونية المسببة للأمراض البولية

الخلاصة

تعد التهابات المسالك البولية ، واحدة من أكثر الحالات المرضية شيوعًا في كل من المجتمع والمستشفيات. وتشير التقديرات إلى أن حوالي 150 مليون شخص في جميع أنحاء العالم يصابون بالتهاب المسالك البولية كل عام ، مع تكاليف اجتماعية عالية من حيث العلاج في المستشفيات والنفقات الطبية. من بين مسببات الأمراض البولية الشائعة المرتبطة بتطور عدوى المسالك البولية ، كانت الإشريشية القولونية المسببة للأمراض البولية ، هي السبب الرئيسي. تمتلك سلالات الاشريشية القولونية UPEC عددًا كبيرًا من عوامل الضراوة (مثل الاسواط والاهداب والسموم ،و أنظمة اكتساب الحديد) التي تساهم في قدرتها على التسبب في المرض ، وكذلك لها القدرة على الالتصاق بالخلايا الظهارية في المسالك البولية يمثل أهم عوامل المحددات الإمراضية. في هذه الدراسة ، تم الحصول على إجمالي 100 عينة من مرضى يعانون من التهابات المسالك البولية الذين توجهوا إلى مدينة الامام الحسين الطبية بمحافظة كربلاء المقدسة لفترة تتراوح من فبراير 2021 إلى أكتوبر 2021. تراوحت أعمار المريضى، بين (15 عامًا - 78 عامًا). في هذه الدراسة ، من بين 89 مسببات أمراض المسالك البولية ، وجد أن 63 عينة فقط (70.79٪) هي بسبب الإشريشية القولونية و 26 (29.21٪) من الكائنات الحية الأخرى. تم إخضاع العزلات لإختبار الحساسية للمضادات الحيوية بطريقة إنتشار قرص كيربي باور المعدلة ، و أظهرت النتائج أن كل هذه العزلات حساسة تماماً (97٪) للامبينيم و 94٪ للكلورامفينيكول. أظهرت العزلات أيضًا حساسية إلى حد أقل لكل من النورفلوكساسين(72%) والجنتاميسين(45%). كما أظهرت الدراسة أن العزلات كانت مقاومة لمضادات الاميكاسين(11%) والببراسيلين/تازوباكتام(15%) ، و الكو- ترايموكسازول (13%) و الاموكسيكلاف(15%). بالمقابل أظهرت العزلات مقاومة أقل لكل من الاريثروميسين(35%) والتتراسيكلين (45%) والتوبراميسين(41%) والأمبيسلين(28%). تم إجراء الكشف الجزيئي عن جينات Fimh باستخدام بادئة PCR محددة للتحقق من وجود هذه الجينات في جميع العزلات. كذلك تم اختبار تسلسل الحمض النووي على 63 عينة سريرية كانت إيجابية للإشرييية القولونية. تم إجراء تفاعلات التسلسل على نواتج تفاعلات البلمرة لجين الFimh. تم كذلك تحديد كيفية تنظم قواعد ثنائي النوكليوتيد في جزء صغير من الحمض النووي من خلال تسلسل الحمض النووي ، حيث كان مدى قيمة توقيع ثنائي النوكليوتيد هي (0.06-0.14) لمعظم عينات fimH من الإشريكية القولونية. تظهر نتائجنا التشابه في ثنائية التوقيعات في جميع أنحاء الجينوم ، وهذا يعني أن جميع العينات لها تجانس وراثي ولديها أنماط فريدة خاصة بالأنواع. ويستفاد منه استخدامه كبصمة تميزية بين الكائنات الحية. كذلك يتشابه نطاق G + C٪ لجميع العينات تقريبًا، حيث تروحت قيمها بين (7.44٪ - 8.15٪ (، مما يعطي علاقة عالية بين العينات. أظهرت النتائج أن تكرار GC و CG هو الأكبر من بين تواقيع النوكليوتيدات الأخرى ، وأن تكرار AG و TC هو الأصغر بين ثنائي النوكليوتيدات الأخرى على التوالي. كما تم استخدام نهج الالتحام للعثور على مثبط مناسب لل Fimh ، تم عمل التحام الأربطة بين الابجنين وبروتين Fimh ،حيث اعطت درجة عالية من الالتحام ، لذلك ، يمكن أن يوفر الابجنين الحماية من التهاب المسالك البولية في الفئران بنسبة 75٪ عند تناوله كوسيلة وقائية ، وحماية حوالي 50٪ من الفئران بعد الإصابة بالعدوى ، لذلك أوصينا في دراستنا باستخدام الابجنين الموجود في البابونك كمنتج عشبي طبيعي (غير مضاد حيوي) في العلاج المساعد مع أدوية أو منتجات أخرى في علاج المسالك البولية. وأيضا نوصي بتطوير مثبطات أخرى لل fimh تكون امنة وفعالة لعلاج حالات التهاب المجاري البولية وخصوصا بعد تفاقم حالات المقاومة البكترية للمضادات الحيوية.