منصة الرسائل والاطاريح: التوصيف الجزيئي لبعض جينات الضراوة والعناصر القفازة Tn3 في بكتريا ال Escherichia coli المعزولة من الاطفال المصابين بالاسهال

الخلاصة

أجريت الدراسة الحالية في مختبر التقانة الحيوية والهندسة الوراثية في جامعة بابل. شملت الدراسة 354 عينة براز (264 مرضى والمتضمنه 98 عزلة , 166 عزلات اخرى و 90 عينة اصحاء). تم جمع البراز من الافراد (1- 10 سنة) من كلا الجنسين من مختبر العيادة الخاصة ومستشفى بابل التعليمي للولادة والاطفال في بابل خلال المدة التي امتدت من تشرين الثاني 2022 الى كانون الثاني 2023 .تهدف الدراسة الى تحديد جينات الضراوة لغرض تشخيص الانواع المرضية للايشيريشية القولونية وتحديد جينات العناصر القافزة لعائلة Tn3 وعلاقتها بمقاومة المضادات الحيوية . تم عزل بكتيريا الايشيريشية القولونية من العينات وتم تشخيصها وفقا لخصائص المزرعة البكتيرية , الكيمائية الحيوية . تم اختبار حساسية المضادات الحيوية بوساطة طريقة Kirby -Bauer. تم الكشف عن جينات الضراوة وجينات العناصر القافزة من عائلة Tn3 عن طريق تفاعل البلمرة (PCR) - ثم بناء شجرة التطورية. واظهرت النتائج ان الايشيريشية القولونية المسببة للامراض المعوية (EPEC) هي النمط المرضي الأكثر شيوعًا التي تم تحديدها بوساطة تقنية PCR في 35 عزلة (35.73٪) والتي تتضمن نوعين نموذجيين يقومان بترميز جينات الضراوة (كلاهما eaeA وbfpA) 16 (45.71٪) وA eae غير النمطي فقط 13 (37.14٪)، bfpA غير نمطي فقط 6 (17.14٪)، يليه الايشيريشية القولونية المسببة لتسمم المعوي (ETEC) في 20 عزلة (%20.41)، نموذجي (سواء elt وstla)، 6 (30%) elt غير نمطي 5 فقط (25%)، الإيشيريشية القولونية المتجمعة المعوية (EAEC) في 19 عزلة (19.39%)، الايشيريشية القولونية الغازية المعوية (EIEC) في 13 عزلة (13.27%)، الايشيريشية القولونية النزفية المعوية (EHEC) في 11 عزلة (11.22%) ،تم العثور على مجموعة السيطرة التي تبدو صحية ظاهرياً تحتوي على فئتين بما في ذلك العزلات غير المسببة للأمراض 45 (50٪) والباقي كانت عزلات ممرضة قد تتكيف في أمعاء الأطفال بعد الشفاء بينما في مجموعة السيطرة كانت الإيشيريشية القولونية المسببة للامراض المعوية (EPEC) هي النمط المرضي الأكثر شيوعًا لـ DEC في 12 عزلة (20.00٪)، نموذجي (كلاهما A eaeوbfpA) 2 (16.67٪) غير نمطي A فقط 8 (66.66٪)، يليه ETEC12 (20.00%)، نموذجي (سواء elt وstla) 2 (16.67%)، elt غير نمطي فقط 3 (25.00%)، EIEC10 (16.66%)، EAEC8 (13.34%)، EHEC3 (5.00%).الادوية المضادة للميكروبات والتي تضم 7 اصناف مختلفة من المضادات الحيوية بأنماط مختلفة للحد من تطور الجراثيم أو قتلها، فعالة بشكل متساوٍ ضد الايشيريشية القولونية. تم العثور على مقاومة البكتريا لجميع المضادات الحيوية تقريبًا، باستثناء الكاربابينيمات، في جميع العزلات البكتيرية. تمت الإشارة إلى أن ثلاثة أنواع على الأقل من المضادات الحيوية مقاومة في جميع العزلات تقريبًا، مما يجعلها مقاومة للأدوية المتعددة (MDR). تمثل مقاومة السيفوتاكسيم 100% من الإيشيريشية القولونية، وهي الأعلى انتشارًا لمقاومة المضادات الحيوية. أموكسيسيلين-كلافولانيت (98.9%)، سيفتازيديم (98.9%)، سيفوتاكسيم (98%)، سيفترياكسون (88%). ألاقل تكرار كان Meropenem و Impenem (1% و 2%) على التوالي وكانت معظم العزلات حساسة للكاربينيمات. الإيشيريشية القولونية المعزولة من الأطفال المصابين بالإسهال بالإضافة إلى 90 سلالة معزولة من الاصحاء تحمل جينات العناصر القافزة من عائلة Tn3 المرتبطة بمقاومة الإيشيريشية القولونية للأدوية المتعددة، Repressor geneهو الأكثر شيوعا في عزلات المرضى ويشكل حوالي ) (60.4%يتبعه Tn2 ( 56.7%)، TEMI (52.4%)، TnAs3 (50.77%)، TnpR (43.3%) بينما في مجموعة السيطرة ، TnpR ( 56.7%) هو معدل انتشار مرتفع يليه TnAs3 (49.23%)، TEMI (47.6%)، (43.45%) Tn2وRepressor gene (39.6(%. وأخيرا، لوحظ أن هذه النتائج تفسر جزئيا ارتفاع معدل انتشار مقاومة المضادات الحيوية في محافظة بابل بسبب سوء استخدام الأدوية. كانت معظم العزلات البكتيرية مقاومة للأدوية المتعددة، وتنتشر في العزلات المسببة للأمراض أكثر من السلالات المتعايشة. في هذه الدراسة ظهر وجود علاقة ارتباط بين وجود جينات الضراوة والعناصر القافزة من عائلة Tn3 مع المقاومة للأدوية المتعددة للبكتيريا المدروسة. تم تحليل بيانات تسلسل الحمض النووي للجينات المدروسة (eaeA لـ EPEC وelt لـ ETECوCVD432 لـ EAEC وTnAs3 وTn2 وtnpR لـ tn3 Transposons) لمريضين و عامل سيطرة واحد لعزلات الإيشيريشية القولونية ومحاذاتها وفقًا لـ BioEdit و برنامج MEGAX وتبين النتيجة وجود تغاير وراثي طفرات داخل الجينوم مقارنة بالتسلسلات المرجعية المتوفرة في قاعدة بيانات GenBank (NCBI).