تعد عدوى المسالك البولية (UTI) من أكثر أنواع العدوى البكتيرية شيوعًا ، حيث تصيب 150 مليون شخص كل عام في جميع أنحاء العالم. تم جمع (١١٧) عينة ادرار من مرضى التهابات المسالك البولية من مستشفى الحلة التعليمي ومستشفى النسائية والاطفال في مدينة الحلة / العراق ، وذلك خلال الفترة من شهر تشرين الثاني ٢٠٢١ الى شباط ٢٠٢٢ .
من خلال دراستنا هذه, تم الحصول على ٥٠ عزلة شخصت كبكتيريا القولون بواسطة الوسط التفريقي EMB ونظام Vitek2 , وتم تأكيد تشخيص العزلات البكتيرية باستخدام الجين التشخيصي 16S rRNA باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل . أظهرت الدراسة الحالية أن نسبة الإصابة عند الإناث هي (٨٢٪) كانت أعلى من الذكور (١٨٪), و كان المعدل الاعلى للإصابة ضمن الفئة العمرية (٢١-٣٠) .
كانت نتائج المقاومة للمضادات الحياتية كالتالي Ampicillin ٥٠ ٪ , Pipercillin ٦٢ ٪, Amoxicillin-clavulanate ٩٨٪ , Cefepime ٣٦ ٪ Ceftazidime ٧٢٪ , Cefixime ٤٨٪ , Cefotaxime ٦٨ ٪ , Aztreonam ٢٦ ٪ Imipenem٤٪, Meropenem ٠ ٪ , Amikacin ٢٢ ٪ , Gentimicin٤٨ ٪, Tobramicin ٤٠٪ , Levofloxacin ٣٤ ٪ , Ciprofloxacin٣٠ ٪ و Trimethoprim ٥٢٪ . أظهرت عزلات بكتريا القولون نسبة عالية من المقاومة المتعددة للمضادات الحيوية المختلفة) MDR (حيث كانت (٤٤) عزلة من أصل (٥٠ ) عزلة MDR , وبنسبة ( ٨٨ ٪).
قدرت انتاجية تكوين الغشاء الحيوي بطريقة الأنابيب التي شملت جميع العزلات وطبقا للنتائج تم تصنيفها كعزلات شديدة الالتصاق ٥ (١٠٪) و عزلات متوسطة الالتصاق ٣٦ (٧٢٪) بينما كانت العزلات ضعيفة الالتصاق ٩ (١٨٪) .
تم إجراء تفاعل البلمرة المتسلسل لتحديد وجود جينات عوامل الالتصاق لجميع عزلات بكتريا القولون المسببة لالتهاب المسالك البولية, وكانت النتائج كالاتي: الجين fimH ٤٦(٩٢٪ ) ، والجينCsgA ٤٩ (٩٨(٪ ، والجين flu ٤٦ (٩٢٪) . في الدراسة الحالية أجري تحليل التسلسل لناتج PCR لجين fimH للتسع عزلات المحلية من بكتيريا القولون مثلت ثلاث مجاميع لتكوين الاغشية الحيوية مظهريا (ضعيف ومتوسط وقوي ) .أنجز تحليل التسلسل لتحديد قواعد النيوكلوتيدات المتشابه مع العزلات العالمية الاخرى خلال تطبيق NCBI- Blast-query nucleotide –online. اظهرت النتائج نسب التشابه لهذه التسع عزلات المحلية مع السلالات المسجلة في البنك الجيني الاخرى كانت بين( ٩٦٪ - ٩٨٪ ). أنجزت المحاذاة المتعددة لتسلسلات النيوكلوتيدات لمعرفة التغاير بين هذه العزلات المحلية باستخدام برنامج BioEdit جنبا الى جنب مع محاذاة الاحماض الامينية . في المواقع الثلاثة ( ٢٠٢و ٢١٤و٢٣٠ ) المتغايرة حدد تكرارا بين العزلات المنتجة للأغشية الحبوبة القوية FimH ( ٧و٨و٩ ) التي قادت الى التغير في انواع الحامض الاميني من التسلسل ٦٨و٧٢و٧٧ , بعد التغيير مقارنة الكودونات مع العزلات المحلية الاخرى . بالرغم من ذلك , العزلات المنتجة للاغشية الحيوية الضعيقة FimH (٢ و٣) اظهرت تغايرا وحيدا في النيوكلوتيدة في التسلسل ١٨٥ مع عزلة واحدة من المنتجة للاغشية الحيوية المتوسطة , والتي كانت ناتجة من تغير في نوع الحامض الاميني عند التسلسل ٦٢.