منصة الرسائل والاطاريح: التوصيف الجزيئي لجينات bla SHV bla TEM, bla CTX-M في عزلات أنواع المتقلبات

الخلاصة

Proteus هي بكتيريا متحركة ، سلبية اللاكتوز ، منتجة لليورياز ، سالبة الجرام ، على شكل قضيب يمكن أن تميز عن العصيات المعوية العادية إلى قضبان ممدودة للغاية مغطاة بملايين الأسواط ، مما يؤدي إلى تجمع مستعمرات. هم جزء من عائلة enterobacteriaceae. في هذه الدراسة تم عزل وتحديد P. vulgaris و P. mirabilis من عينات بول المرضى الذين يعانون من التهابات المسالك البولية (UTIs) .تم أخذ مائتين وعشره عينة ادرار من مرضى في مستشفى الإمام الصادق التعليمي ، ومستشفى الحلة التعليمي ، ومستشفى المرجان التعليمي في بابل. تم جمع عينات هذه الدراسة بين سبتمبر 2021 ويوليو 2022. اشتملت الدراسة الحالية على 40 عزلة من Proteus mirabilis و P. vulgaris معزولة من 210 عينة بول سريرية (سميت PM 1 إلى PV40). تم التعرف على هذه العزلات اعتمادًا على الصفات المورفولوجية للمستعمرات والخلايا ، والاختبار البيوكيميائي ، و VITEK 2 المضغوط. إنه يزدهر على أجار الدم ، وآجار MacConkey ، ووسائط أجار الكروموجينيك في المسالك البولية. إنه يتحرك وينتج طبقة رقيقة من دوائر متحدة المركز تحاكي التموجات الناتجة عن رمي صخرة في بحيرة بسبب نمو حشد على أجار الدم. ومع ذلك ، في أجار MacConkey ، لا يتجمع وينتج مستعمرات ناعمة أو خفيفة أو عديمة اللون. تم إجراء اختبار الحساسية للمضادات الحيوية ضد 11 نوعًا من المضادات الحيوية ، باستخدام طريقة انتشار القرص وفقًا لمعهد معايير البكتيريا المسببة للأمراض في المختبر السريري ، CLSI-2022. أظهرت غالبية العزلات مقاومة للمضادات الحيوية وخاصة المضادات الحيوية β- lactamase. وجد أن معظم العزلات البكتيرية تمتلك مقاومة متعددة للمضادات الحيوية المختبرة. أظهرت النتائج أن أكثر مضادات الجراثيم فعالية ضد عزلات P. mirabilis و P. vulgaris كانت الاريثروميسين بمقاومة عالية (97.5٪). يليه توبراميسين 5 بنسبة (85٪) ، أمبيسلين مع (82.5٪) ، كلورامفينيكول (60٪) ، بيبراسيلين (55٪) ، سلفاميثوكسازول ، أزيثروميسين مع مقاومة (52.5٪) ، بينما أظهرت مضادات حيوية أخرى مقاومة أقل وحساسية عالية مثل الميروبينيم والإيميبينيم أظهرت مقاومة منخفضة لعزلات P. mirabilis و P. vulgaris مع (35٪) ، سيبروفلوكساسين (30٪) ، جنتاميسين (15٪). و imipenem (12.5 ٪). تم استخدام اختبار طريقة زراعة الانسجة ، والذي كان يعتقد أنه الأكثر حساسية ، لدراسة تكوين البكتيريا الحيوية. تمت دراسة قدرة P. mirabilis و P. vulgaris على إنتاج الغشاء الحيوي الرقيق. 40 عزلة بكتيرية متقلبة (P. mirabilis و P. vulgaris) تم فحصها واكتشف أن جميع العزلات (100٪) شكلت غشاء حيوي بالنسب التالية: 15٪ من البيوفيلم ضعيف ، 77.5٪ متوسط ، و 7.5٪ قوي. تم استخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل لفحص 3 جينات للطيف الممتد من lactamase –β(ESBLS) في P. mirabilis و P. vulgaris باستخدام مادة أولية محددة لكل جين من bla TEM ،bla SHV و bla ctx-m. بعد إجراء الرحلان الكهربائي ، أظهرت النتائج في CTX-M أن النتائج الإيجابية لتفاعل تفاعل البوليميراز المتسلسل بيتا لاكتاماز تحتوي على 33 (82.5٪)SHV ،38 (95%) TEM و 37 (92.5٪) جينات CTX-M. وجد أن جميع عزلات P. mirabilis كانت متطابقة بنسبة 97-100٪ مع مصادر العزلات المحددة في بنك الجينات (NCBI) ، وأظهرت النتائج أن أعلى نسبة مطابقة للعزلات كانت 100٪. نشأت في العراق والهند. أظهرت هذه الدراسة أن جين bla TEM هو الجين الأكثر شيوعًا بين هذه العزلات ، يليه جين bla CTX-M ثم bla SHV. نظرًا لأن بكتيريا P. mirabilis كانت أكثر انتشارًا من P. vulgaris في هذه الدراسة ، فقد تم اختيار ثمانية عزلات من P. mirabilis لدراسة التسلسل الجيني.الحمض النووي الجينومي الكامل لثمانية عزلات PMI إلى PM8. المعزولة من مناطق جغرافية مختلفة من العراق. تم إجراء تسلسل جينات bla TEM و bla SHV و bla ctx-m ، وتم تحديد مواقع هذه الجينات على جينوم العزلات. و تم إجراء تحليل شجرة النشوء والتطور باستخدام برنامج MEGA X10.2.4 ، وتعزل الدراسة الحالية مع NCBI سلالات البنك العالمي P. mirabilis ، وجدت أن 4 عزلات (PM1 و PM2 و PM3 و PM4) كانت مرتبطة بالهند ، وعزلتان (PM5 و PM8) كانت مرتبطة بالعراق وعزلة واحدة (PM6) كانت مرتبطة بمصر. لذلك ، يلزم إجراء بحث إضافي لإنشاء خريطة التنوع الجيني لعزلات P. mirabilis و P. vulgaris بسبب الترددات المتغيرة في تسلسل جينات bla TEM و bla ctx-m و bla SHV للعزلات.