منصة الرسائل والاطاريح: تواجد وانتشار جينات البيتالاكتاميزampC بين العزلات السريريه لبكتريا Echerichia coli متعددة المقاومة للمضادات الحياتيه في محافظة بابل

الخلاصة

من المعروف عالميا أن الإشريشيا القولونية هي بكتريا تعايشية مع البشر وكذلك في العديد من أنواع الحيوانات ، في الجهاز الهضمي البشري تفتقر إلى الضراوة. ومع ذلك ، عندما توجد خارج الأمعاء ، يمكن أن تسبب الإشريشيا القولونية عدة أمراض. ظهرت مقاومة مضادات الميكروبات (AMR) كواحدة من مشاكل الصحة العامة الرئيسية في القرن الحادي والعشرين. تم اكتشاف إنزيمات الطيف الممتد ( (ESBLs وإنزيمات AmpC في جميع أنواع العائلة المعويه تقريبًا. تم جمع 1874 عينه سريريه من اربع مستشفيات رئيسيه في مدينة الحله وهي مستشفى مرجان التعليمي ومستشفى الحله التعليمي العام ومستشفى بابل التعليمي للولاده والاطفال ومستشفى الامام الصادق (ع) للفتره من شباط الى نهاية حزيران 2022 خلال الدراسة الحالية ، تم عزل الاشريشيا القولونية من عينات سريرية مختلفة والتي تتضمن البول وإفرازات الحروق والإفرازات المهبلية والبلغم وقرحة القدم السكرية والبراز والسائل الدماغي الشوكي والدم ومسحة الأذن عن طريق الزراعة على MacConkey agar ، Eosin Methylene blue agar بالإضافة إلى العديد من الاختبارات الكيميائية الحيوية لغرض تشخيص البكتريا. تم الكشف عن قدرة إنتاج البيتالاكتميز لجميع عزلات الإشريشيا القولونية وذلك باستخدام النيتروسيفين ، وتم إجراء حساسية المضادات الحيوية لعزلات الاشريشيا المنتجة للبتالاكتميز وفقا ل CLSI ، 2023 باستخدام جهاز الفايتك 2 وطريقة انتشار الاقراص. استخدم تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) للكشف الجيني عن جينات البلازميد pampC , وجينات ESBL وجينات الكاربابنيمز وجينات مقاومة الكوينولون المحموله على البلازميد (PMQR) وجينات مقاومة للامينوكلايكوسيد وجينات مقاومة الكوليستيين وintegrin class 1 وأخيرا تم إجراء تسلسل الحمض النووي لبعض الجينات العائدة pampC. وجدت النتائج أنه من بين 1874 عينة سريرية ، كانت 231 عزلة للاشريشيا القولونية, ومنها 112 (48.5٪) منتجه للبيتالاكتميز. كان معدل عزل الإشريشيا القولونية غالبا من البراز 38(61.4٪) يليه البول 118(18.4٪). فيما يتعلق بجنس المرضى ، تم جمع عزلات الإشريشيا القولونية من البول في الغالب من المرضى الإناث 77(65.3٪)، في حين الحروق وقرحة القدم السكري في الغالب من الذكور 19 (63.3٪) و 9(69.3٪) على التوالي. بالنسبه لفحص المضادات الحيويه ASTتم فحص الإشريشيا القولونية ل 30 نوعا من المضادات الحيوية تنتمي إلى 15 فئة، 14 نوعا من البيتالاكتام و 16 نوعا من غير البيتالاكتام، وكشفت النتائج أن جميع العزلات كانت مقاومة للأمبيسيلين، أموكسيسيلين، أموكسيسيلين/كلافولونات، وبيبيراسيلين 111(99.1٪). فيما يتعلق بالعينات السريرية ، كانت الاشريشيا القولونية المعزولة من البول عالية المقاومة للسيفازولين 53(94.6٪) والسيفترياكسون 52(92.8٪) والأستريونيم 42(75٪) وحمض الناليديكسيك 50(89.3٪). وكانت الاشريشيا القولونية المعزولة من الإفرازات المهبلية عالية المقاومة للسيفازولي17 (100٪) ، والأستريونيم 17(100٪) وسيبروفلوكساسين 17(100٪) والليفوفلوكساسين 17(100٪) وسبارفلوكساسين 17(100٪) وحمض الناليديكسيك 17(100٪) وكانت الاشريشيا القولونية المعزولة من قرحة القدم السكري عالية المقاومة للسيفازولين (100٪) و سيفترياكسون 7(100٪) و أزتريونيم 7(100٪) و سيبروفلوكساسين 6(85.7) وليفوفلوكساسين 6(85.7٪) و سبارفلوكساسين 6(85.7٪) ونورفلوكساسين 6(85.7٪) على الرغم من ذلك ، كانت عزلات الاشريشية القولونيه حساسة للميروبينيم 112(100٪) وتيجيسيكلين 112(100٪) وإرتابينيم 108(96.5٪) وإمبينيم 107(95.5٪) وأميكاسين 107(92٪) وإيسيباميسين 110(98.2). جميع العزلات اظهرت نمط MDR لمقاومة الاشريشيا القولونية. من بين 112 عزلة إشريكية قولونية منتجه للبتالاكتميز 74(66٪) كانت ESBL 4(3,5٪) مقاومة للكاربابينيم و37(33٪) كانت مقاومة للامينوكلايكوسايد و73(65.1٪) كانت مقاومه للكوينولون 27(24.1٪) كانت مقاومة للكوليستين. كشفت نتائج تفاعل البوليمر المتسلسل لجينات ESBL عن ارتفاع معدل انتشار blaCTX-M (100٪) ، بين عزلات الاشريشيه القولونيه المنتجة ل ESBL ، تليها blaSHV (87.8٪) ، blaOXA (85.1٪) و blaTEM (79.7٪). كانت نتائج تفاعل البوليمر المتسلسل لجينات الكاربابينيماز هي blaOXA (100٪) و blaNDM (75٪) ، وجينات مقاومة الكوينولون بوساطة البلازميد qnr A (35.5٪) و qnr B (32.2٪)، وجين أمينوكليكوسيدات ACC(6)Ib-cr (100٪) ، وجينات مقاومة الكوليستين mcr 2(55.5٪) و mcr 3(22.2٪) ، وأخيرا تم اكتشاف Int1 في (99.1٪). فيما يتعلق بجينات pampC ، أظهرت نتائج تفاعل البوليمر المتسلسل انتشارا مرتفعا لجينات blaCMY (88.5٪) تليها blaCIT (57.7٪) و blaDHA (42.3٪) ،الجينات blaFOX ، blaMOX ، blaEBC ، blaACC لم يعثر عليها في الدراسة الحالية. من بين 26 عزلة اشريشيه قولونيه منتجة ل AmpC ،هنالك عزله واحده (3.85٪) تحمل 3 أنواع من جينات pampC ، و 19عزله (73٪) تحمل نوعين من pampC ، و 5 عزلات (19.3٪) تحمل جين واحدة وعزله واحده (3.85٪) لا تحمل أي واحد من جينات الدراسة. تم الكشف عن تسلسل الحمض النووي blaDHA و blaCIT ، وكلها متوافقة مع blaDHA عند مقارنتها ب NCBI بنقاوة 100٪ ، blaCIT مشابهة جدا .blaCMY-42 من هذه الدراسه, يمكن ان نستنتج ان ESBL كانت اكثر انتشارا من AmpC في الاشريشيه القولونيه المنتجه للبيتالاكتميز لكن Amp C كانت اكثر مقاومة للمضادات الحيويه عند مقارنتها ب ESBL , جميع عزلات الاشريشيه القولونيه كانت مقاومه للامبسيلين والاموكسيسلين و الاموكسيسلين / الكلافولونات , في حين انها حساسه للاميكاسين و امبينيم وميرونيم و التيكيسايكلين. تم الكشف عن ارتفاع معدل انتشار جينات ESBL وجينات pampC مثل جين blaCMY وجين ACC(6) Ib-cr وجين Int1 بين عزلات الاشريشيا القولونيه MDR.