منصة الرسائل والاطاريح: دراسة جزيئية للنوروفيروس والفيروس النجمي وعلاقته بتعدد الاشكال الجيني لمستقبل الشبيه بالتول نمط 7 والانترفيرون كاما في الاطفال المصابين بالتهاب المعدة والامعاء

الخلاصة

يعد فايروس النورو وفايروس الأسترو (الفيروسات النجميه) من العوامل المسببة لالتهاب المعدة والأمعاء الفيروسي الذي يصيب جميع الفئات العمرية، ولكن في أغلب الأحيان يكون اكثر حدوثا عند الشباب وكبار السن والأشخاص في المجتمعات شبه المغلقة مثل المستشفيات ودور رعاية المسنين والقواعد العسكرية والسفن السياحية. إن التشخيص الحساس والسريع للعوامل المسببة لالتهاب المعدة والأمعاء الفيروسي هو مفتاح التنفيذ الفعال لأنظمة مكافحة العدوى. يتميز إنترفيرون كاما (IFN-) بقدرته على تنظيم الاستجابات المناعية للمضيف ؛ ومع ذلك ، فإن نشاطه المباشر المضاد للفيروسات لم يتم دراسته جيدًا. المستقبل الشبيه بالرسم 7 (TLR7) هو مستقبل للتعرف على الأنماط يتعرف على الحمض النووي الريبي الفيروسي بعد الالتقام الخلوي للفيروس ويبدأ استجابة مناعية قوية تتميز بإنتاج IFN وإنتاج السايتوكين المحفزة للالتهابات. تهدف الدراسة الحالية إلى تحديد الأنماط الجينية لفيروس نوروفيروس و الاسترو فايروس (الفايروسات النجميه) وكذلك تأثير الانترفيرون كاما والمستقبل شبيه بالرسم 7 عند الرضع والأطفال الذين يعانون من التهاب المعدة والأمعاء . كانت هذه الدراسة عبارة عن دراسة حالة- ضابطة شملت 200 طفل تم تقسيمها للمجاميع التالية: 150 مريضًا مصابًا بألتهاب الامعاء, 50 مريضًا يبدو أنهم يتمتعون بصحة جيدة) 116 ذكور و 84 أنثى ( تم جمعها من مستشفيات الأمومة والأطفال التعليمية في محافظات الفرات الاوسط في العراق. كانت المجموعات المدروسة لها أعمار مختلفة تتراوح بين 6-122 شهرًا. أجريت الدراسة في قسم الأحياء المجهريه ، كلية العلوم، جامعة بابل خلال الفترة ما بين فبراير 2021 ويونيو 2022. تم جمع مسحات من البراز وتم اخذ 3-5 مل من عينة الدم ثم تم جمع الجينوم الفيروسي والحمض النووي الكلي. تم الحصول عليها وتخزينها عند -20 درجة مئوية / -80 درجة مئوية حتى يتم استخدامها. باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل تم اكتشاف الأنماط الجينية للفايروسات النوروفايروس والفايروسات النجميه ، وأخيراً عزل جينات النوروفايروس والفايروسات النجميه التي تم إرسالها للتسلسل. أجريت فحوصات روتينية أخرى للانترفيرون كاما ,المستقبل الشبيه بالرسم- 7 عند الرضع والأطفال الذين يعانون من التهاب المعدة والأمعاء. •الانماط الجينية في هذه الدراسة لنوروفيروس (النمط الجيني الاول ,الثاني ,الثالث) موجبًا في 29 (37.6٪) من مجموع 77 وسلبيًا في 48 (62.4٪) من مجموع 77 مريضًا. وكان هناك فرق معنوي P- Value= 0.03)) بين مجموعة المرضى , والمجموعة الضابطة. أشارت النتائج الحالية النوروفايروس النمط الاول ,الثاني ,الثالث إلى وجود أربعة متغيرات من النيوكليوتيدات في العينات التي تم فحصها ، وهي 56G> A و 147A> T و 231 C> T و 288 T> C. تم الحصول على تسلسل جميع النوكليوتيدات في هذه الدراسة. من أجل ايجاد التسلسل الجزئي للجين VP-1 تمت محاذاته بشكل أكبر وثمانية فقط (سته من النمط الجيني الثاني واثنان من النمط الجيني الثالث) تم إيداعها في قاعدة بيانات البنك الجيني للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية مع تعريف أرقام الانضمام من (SUB11565544 Seq1 ON678619 ؛ ON678620 ؛ ON678621 ؛ ON678622 ؛ ON678623 ؛ ON678624) و SUB11565548 Seq1 ON678617 و ON678618 ؛ على التوالى. • تم إنشاء الشجرة التطورية للتسلسل الجزئي للجين للنوروفايروس باستخدام 8 عزلات من هذه الدراسة مع تسلسلات من النوكليوتيدات المشابه من البنك الجيني ذو رقم الانضمام EU310927.1. • النتيجة الإيجابية الإجمالية لـ الفايروسات النجميه وفقًا لتفاعل البلمرة التسلسل تظهر أن 18.1٪ (14 من 77 حالة) كانت إيجابية أقل من 81.9٪ (63 من 77 حالة) سلبية. ذات فارق معنوي (= 0.04) بين مجموعة المرضى. أشارت النتائج الحالية لـ AsV إلى وجود ثلاثة متغيرات للحمض النووي في العينات التي تم فحصها ، وهي 86C> T و 131G> A و 239G> A المكتشفة في العديد من العينات السريرية التي تم فحصها. تم اكتشاف جميع تسلسلات النوكليوتيدات التي تم تسجيلها في هذه الدراسة من أجل التسلسل الجزئي للجين ORF خصيصًا للنمط الجيني للفايروسات النجميه وقد ظهرت ستة تسلسلات مسجلة حديثًا فقط تم تسجيلها في قاعدة بيانات البنك الجيني في مركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية مع تعريف أرقام التسلسل (Astrovirus BankIt2589912 Seq1 ON669284 ؛ ON669285 ؛ ON669286 ؛ ON669287 ؛ ON669288 ؛ و ON669289. • شجرة النشوء والتطور للتسلسل الجزئي عملت باستخدام 6 عزلات من هذه الدراسة مع تسلسلات مماثلة للحمض النووي الفايروسي في البنك الجيني ذو رقم التسلسل MH933759.1)).