منصة الرسائل والاطاريح: لتوصيف الجزيئي لجينات البيتالاكتميز واسعة الطيف في عزلات بكتريا الزائفة الزنجاريه

الخلاصة

جمعت مائة وخمسين عينة لكلا الجنسين باختلاف الأعمار من مستشفيات بابل (مستشفى الحلة التعليمي ، مستشفى مرجان التعليمي، مستشفى الامام الصادق التعليمي) وكذلك من مستشفيات بغداد (مستشفى الحروق التخصصي ، مستشفى الشهيد غازي الحريري ، مستشفى بغداد التعليمي ، المركز الوطني. للمختبرات التعليمية). قسمت هذه العينات إلى مجموعتين ، المجموعة الأولى تضمنت خمسة وخمسين مسحة تم الحصول عليها من الحروق والمجموعة الثانية تضمنت خمسة وتسعين مسحة جروح تم الحصول عليها من إصابات مختلفة. جمعت هذه العينات من سبتمبر 2021 إلى يناير 2022. عزلت ستة وأربعين(30%) عزلة من Pseudomonas aeruginosa ورمزت بالرمز (PA1 to PA46) وشخصت اعتمادا على الصفات المضهرية, الزرعية, المجهرية, الاختبارات الكيموحيوية و Vitek 2 compact ، بينما لوحظ أن (36%) 54 عزلة لبكتيريا أخرى تم الحصول عليها من عينات الجروح بينما كانت (33.3%) 50 من العينات ليس لها نمو بكتيري. استخلص الحمض النووي من عزلات P. aeruginosa باستخدام DNA mini kit وقيست نقاوتها باستخدام جهاز nanodrop (1.96-2.49 nm) اكد تشخيص P. aeruginosa باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) للجين النوعي P. aeruginosa ، وكانت مطابقة بنسبة 100 % مع النتائج التي تم الحصول عليها من فحوصات الصفات المضهرية, الزرعية, المجهرية, الاختبارات الكيموحيوي تم فحص حساسية المضادات الحيوية ل 17 نوعًا من المضادات الحيوية ، باستخدام طريقة نشر القرص وفقًا لمعهد المعايير السريرية للبكتيريا المسببة للأمراض في المختبر السريري .CLSI-2021 أظهرت النتائج أن جميع العزلات الـ 46 مقاومة للتوبراميسين ، البيبيراسيلين ، السيفبيمي ، الإيميبينيم ، أوفلوكساسين ، الأزتريونام ، النيتيلميسين ، (100%) ، بينما النورفلوكساسين (39%) ، البيبيراسيلين-تازوباكتام (26%) ، الليفوفلوكساسين (39%). أميكاسين (74%) ، ميروبينيم (41%) ، سيبروفلوكساسين (43%) ، دوريبينيم (37%) ، جنتاميسين (87%) ، سيفتازيديم (87%) ، جاتيفلوكساسين (28%). تمت دراسة التكوين البكتيري للغشاء الحيوي باستخدام اختبار طريقة زراعة الانسجة والذي يعد الأكثر حساسية ، وأظهرت النتائج أن 34 عزلة كانت قادرة على إنتاج الغشاء الحيوي. تم استخدام تفاعل البلمرة المتسلسل لفحص3 جينات من β-lactamase واسعة الطيف (ESBLs) في P. aeruginosa باستخدام المتمم لكل جين: .blaTEM, blaSHV, blaCTX-m بعد إجراء الترحيل الكهربائي الهلامي ، أظهرت النتائج أن عزلات P. aeruginosa حاوية على blaTEM 26/46 (58.69%) blaSHV 28/46 (63%), و blaCTX-M 31/46 (67.39%) وجد أن جميع عزلات P. aeruginosa كانت متطابقة بنسبة 95.86-100 % مع مصادر العزلات المحددة في بنك الجينات (NCBI) ، وأظهرت النتائج أن أعلى معدل مطابقة للعزلات كان %95-100. نشأت في مصر. كشفت هذه الدراسة أن مقاومة الأدوية المتعددة (MDR) لبكتيريا P. aeruginosa كانت أكثر البكتيريا عزلًا من الحروق ، وأن جين blaCTX-M كان أكثر جينات بيتا لاكتام واسعة الطيف(ESBLs) بين هذه العزلات متبوعة بـ blaSHV. الجين متبوعًا بـ bla TEM. تم استخراج الحمض النووي الجينومي الكامل لتسع عزلات من PA1 إلى PA9 معزولة من مناطق جغرافية مختلفة في العراق. تم إجراء تسلسل جينات blaTEM و blaSHV و blaCTX-M ، وتم تحديد مواقع هذه الجينات على جينوم العزلات. تم إجراء تحليل شجرة النشوء والتطور باستخدام برنامج MEGA X10.2.4 ، وأظهرت مطابقة عزلات الدراسة الحالية مع سلالات Pseudomonas العالمية التابعة لبنك NCBI-Gen ، أن عزلة واحدة (PA1) اصلها في الإمارات العربية المتحدة ، وعزلتان (PA2 و (PA3 في الهند ، ثلاث عزلات PA4) و PA5 (PA6 اصلها في مصر و ثلاث عزلات PA7) و PA8 و (PA9 اصلها في إيران. وبالتالي ، فإن الترددات المتغيرة في تسلسل جينات blaTEM و blaSHV و blaCTX-M تحتاج إلى مزيد من الدراسات لإنشاء خريطة التنوع الجيني لـ .P. aeruginosa.