منصة الرسائل والاطاريح: الكشف الجزيئي لجينات الخطورة المتحسسة لعدوى الخمائر لمرضى كوفيد _19 في محافظة بابل

الخلاصة

أجريت هذه الدراسة في كلية علوم للبنات بجامعة بابل. تم جمع 146 عينة من مسحة الفم وكانت 56 عينة من مرضى مصابين بعدوى Covid-19 ، و 50 عينة من الأشخاص الذين تعافوا و 40 عينة من الأشخاص الأصحاء عن طريق المسحات ذات الوسط الناقل. وتم سحب 3 مل من الدم بواقع 60 عينة دم منها 20 مريضا و 20 شخصا تماثلوا للشفاء و 20 من الاصحاء. تم حقن الدم مباشرة في أنبوب EDTA. تم استخدام صندوق بارد لغرض نقل العينات من المستشفى إلى المختبر وحفظها تحت درجة -20 درجة مئوية في حالة التجميد العميق لاستخدامها في الدراسة الجزيئية. تم جمع العينات على مدى 4 أشهر من نوفمبر 2021 إلى فبراير 2022. جمعت جميع العينات السريرية من المرضى الذين يرقدون في قسم العناية المركزة من مستشفى مرجان (مدينة المرجان الطبية) في محافظة بابل. تم أخذ عينات من المرضى تحت إشراف الطبيب المختص. بعد تشخيص إصابة المرضى بفيروس كوفيد -19 ، تم أخذ كل العينات لكلا الجنسين وفئات عمرية مختلفة تراوحت بين 22_89 سنة. هدفت هذه الدراسة إلى عزل الفطريات المسببة للأمراض من خلال مسحات الفم للمرضى والأفراد الاصحاء والمتشافين ، تقييم عوامل الخطر ، تحديد العزلات الفطرية بالطرق التقليدية. اختبار عوامل الضراوة وفعالية المضادات الفطرية للعزلات الفطرية. استخراج الحمض النووي لعينات الدم لكل مريض والكشف الجزيئي لبعض عوامل الخطر الجينية مثل جينات (CLEC7A و TLR8). تم زرع جميع العينات السريرية على SDA و PDA والخميرة التي تم تحديدها بواسطة CHROM Agar والكشف عن عوامل الضراوة لخميرة Candida spp. مثل إفراز الفوسفوليباز والليباز وتكوين الأغشية الحيوية وانحلال الدم. أظهرت النتائج أن نسبة الإصابة عند الذكور أعلى منها عند الإناث حيث بلغت عند الذكور(55.4%) من المرضى بينما كانت الإناث (44.6%) على التوالي، بالمقابل كانت نسبة المتشافين عند الاناث (64.0%) اعلى مما عند الذكور (36.0%). وقد كشفت هذه الدراسة أن السن الأكثر تضرراً بين الجنسين تتراوح أعمارهم (65-74 سنة). وبلغت نسبة إجمالي العينات الإيجابية من الفئات الثلاث 83 (56.84%). حيث كانت النسبة المئوية للمرضى (29.45%)، بينما أظهرت الزرع الإيجابية في المتشافين ومجموعة السيطرة 13.7% لكل منهما. تم عزل وتشخيص ستة أنواع من الخميرة من عينات المرضى كانت أعلى نسبة لخميرة C. albicans حيث بلغت (%(44.6، والمرتبة الثانية لخميرة C. parapsilosis بنسبة مئوية بلغت (17.9%) , اما كل من الخمائر C.dubliniensis ، C. glabrata و C. krusei بمعدل النسبة المئوية (7.1%) و C. tropicalis بلغت (5.4%). في المتشافين بلغت نسبة خميرة C. albicans (20.0%) تلتها بالمرتبة الثانية C.kruzei بنسبة (6.0%) بينما في مجموعة السيطرة بلغت نسبة خميرة C. albicans (15.0%) تلتها بالمرتبة الثانية C. parapsilosis بنسبة (7.5%). لتقييم عوامل الضراوة لأنواع الخمائر قيد الدراسة ، أظهرت النتائج أن معظم الخمائر تمتلك عوامل ضراوة عالية. أكثر مضادات الفطريات فاعلية هي فلوكونازول ، كلوتريمازول ونيستاتين ولها أعلى نسبة حساسية ضد المبيضات بنسبة 72.3% و 67.7% و 61.5% على التوالي ، وبلغت نسبة الأمفوتريسين-ب 58.4%. تم إجراء تعدد الأشكال لجين TLR8 على 60 عينة من الحمض النووي للدم (20 مريضًا و 20 شخصًا يتعافى و 20 شخصًا سليمًا) بواسطة بادئ رباعي. عند المقارنة بين المرضى والمجموعة السيطرة ، كان تردد الأنماط الجينية AA و AG و GG لتعدد الأشكال الجيني TLR8 (rs3764880 A / G) هو على التوالي 40٪ و 35٪ و 25٪ في المرضى ، بينما على التوالي 60٪ و 0٪ و 40٪ في مجموعة السيطرة. بلغ تردد أليلات للجين TLR8 تعدد الأشكال الجيني للأليل A 57.5٪ في المرضى و 60.0٪ في المجموعة السيطرة ، بينما تردد الاليل G بلغ 42.5٪ في المرضى و 40.0٪ في المجموعة االسيطرة. بينما أظهرت نتائج التردد للاشخاص المتعافين لتعدد الأشكال الجينية AA و AG و GG لـ TLR8 (rs3764880) A / G هو على التوالي 25٪ و 60٪ و 15٪ وتردد أليلات للأليل A و G. هي 55.0٪ و 45.0٪ على التوالي. تم إجراء تعدد الأشكال لجين CLEC7A على 60 عينة من دم الإنسان بواسطة تتابع نتائج PCR. للتحقق من تعدد الأشكال في هذا الجين ، لوحظ نمطين وراثيين ، ظهرتSNPs rs3901532 C / T في الموقع 152 وظهرت rs3901533 A / C في الموقع 64. تردد الأنماط الجينية CC و CT و TT لجين CLEC7A (rs3901532) C / T على التوالي 20٪ ، 45٪ و 35٪ في المرضى ، بينما على التوالي 20٪ ، 55٪ و 25٪ في المجموعة السيطرة. وبلغ تردد أليلات للجين CLEC7A (rs3901532) C / T بلغ للأليل C نسبة 42.5٪ في المرضى و 47.5٪ في المجموعة السيطرة ، بينما تردد الاليل T بلغ في المرضى و 52.5٪ في المجموعة السيطرة. في حين أن تردد الأنماط الجينية AA و AC و CC لتعدد الأشكال الجيني CLEC7A (rs3901533) A / C هي على التوالي 20٪ و 50٪ و 30٪ في المرضى ، بينما على التوالي 25٪ و 60٪ و 15٪ في المجموعة السيطرة. وبلغ تردد أليلات للجين CLEC7A (rs3901533) A / C للأليل A 45٪ في المرضى و 55٪ في المجموعة السيطرة ، بينما تردد الاليل C هو 57.5٪ في المرضى و 45٪ في المجموعة السيطرة.